Aplicação da genômica para o diagnóstico de doenças raras e do risco hereditário de câncer no Brasil em serviços públicos de saúde.

1. Realizar Sequenciamento do Genoma Completo de 3000 indivíduos com doenças raras e potencial risco hereditário de câncer;
2. Avaliar geneticamente as diversas coortes de doenças raras, incluindo o aconselhamento familiar para os indivíduos com alteração genética estabelecida pelo SGC;
3. Avaliar geneticamente pacientes com potencial risco hereditário de câncer, incluindo o aconselhamento familiar para os indivíduos com alteração genética estabelecida pelo SGC;
4. Avaliar geneticamente amostras humanas advindas de outras coortes, por demanda do Ministério da Saúde;
5. Catalogar e disponibilizar um banco de variantes patogênicas e provavelmente patogênicas e os dados fenotípicos dos indivíduos estudados;
6. Atualizar os Protocolos Operacionais Padrão (POP) de preenchimento de dados e de informações clínicas, de coleta e processamento de amostras biológicas e Sequenciamento Completo do Genoma, tratamento dos dados do sequenciamento, análise e classificação de variantes genéticas e formulação de laudo;
7. Publicar 3 artigos científicos de casos isolados ou coletivos dentro de subgrupos específicos de patologias;
8. Realizar estudo de custo-efetividade do uso diagnóstico do genoma aplicado a 3 coortes específicas;
9. Treinar profissionais de saúde de 2 centros participantes para análise e interpretação conjunta dos resultados encontrados no Sequenciamento Completo do Genoma Humano;
10. Manter o armazenamento em nuvem para guarda dos dados de todos os pacientes sequenciados.

O sequenciamento de pacientes com doenças raras e câncer hereditário proverá diagnóstico genético de alta qualidade com impacto imediato em seu seguimento e tratamento. Todas as regiões do Brasil serão contempladas, resultando na criação de um banco de dados da genética da população brasileira. A aplicação do sequenciamento completo do genoma na investigação desses indivíduos deve complementar e expandir Formulário 3 Apresentação de Projeto no Âmbito do PROADI-SUS Página 5 de 26 a política atual, aumentando significativamente a capacidade diagnóstica e permitindo avaliar o custoefetividade dessa ferramenta em vários cenários para uso no SUS. A uniformização de protocolos e a base de dados, que será incorporada ao SUS, terão grande importância na implementação de projetos de medicina de precisão. As publicações científicas sobre as variações genéticas e a criação de protocolos de ação de assistência à saúde, para as condições contempladas no estudo, serão consequência direta do projeto e poderão ainda ser estudadas por outros grupos durante um longo período após sua conclusão. Portanto, é importante ressaltar que os benefícios deste projeto não se limitam ao contexto e a sua duração em si, pois outras instituições e grupos de pesquisa poderão desenvolver estudos adicionais utilizando o banco de dados criado e disponibilizado ao MS.

Este é um estudo observacional, de coorte, transversal e descritivo, que realizará o SGC em pacientes com suspeita clínica de doenças raras de suposta causa genética e câncer hereditário. Os indivíduos probandos recrutados nos diversos centros participantes do projeto terão seu genoma completo sequenciado de acordo com os protocolos descritos abaixo. A devolutiva dos resultados será realizada em parceria com os centros de pesquisa que aderirem ao projeto.
Inclusão de centros e pacientes
Os centros participantes receberão informação do estudo através de um convite. Para fazer parte do estudo clínico, os investigadores têm de confirmar que: (1) receberam e leram o protocolo e concordam com a participação no estudo; (2) irão seguir o protocolo de acordo com os critérios de inclusão e exclusão dos pacientes; (3) o estudo teve aprovação do comitê de ética da instituição (caso presente); (4) que todos os pacientes participantes do estudo receberão e assinarão o termo de livre consentimento informado (TCLE) e uma cópia será armazenada; (5) concordam em fornecer as informações necessárias através de sistema de coleta de dados na plataforma via web conforme definição prévia do protocolo; (6) que o material necessário
para pesquisa será enviado conforme indicado.
Quando o centro for totalmente registrado e treinado, estará apto para o recrutamento de pacientes, de acordo com a figura 2. Os pacientes devem ser consentidos para participação no estudo usando o Termo de Consentimento Livre e Esclarecido (TCLE). Para os indivíduos menores de idade ou incapazes, o responsável assinará um TCLE específico.