Onco-Genomas Brasil: mapeamento do câncer de mama e de próstata no sistema público brasileiro

1. Identificar as alterações genéticas relacionadas ao prognóstico tumoral por meio da análise do exoma completo;
2. Rastrear pacientes com mutações em genes predisponentes a câncer e oferecer orientações às equipes médicas dos centros para seguimento clínico adequado para os pacientes com variantes genômicas identificadas como patogênicas/provavelmente patogênicas.
3. Gerar dados genômicos e fenotípicos associados para alimentar o banco de dados do Programa Genomas Brasil;
4. Caracterizar a ancestralidade da população estudada;
5. Referentes exclusivamente ao Eixo 1: Identificar variantes genéticas preditivas de resposta ao tratamento neoadjuvante para pacientes com câncer de mama dos subtipos estudados.

O projeto contribuirá com o Programa Genomas Brasil, por meio de informações genômicas provenientes da análise do WES germinativo (de amostras de sangue) 500 pacientes com câncer de próstata metastático ou câncer de mama subtipo HER-2 positivo e 490 pacientes com câncer de mama subtipo triplo negativo. O projeto contribuirá também com dados fenotípicos e de histórico clínico desses pacientes, possibilitando subsídios para predições de risco e de direcionamentos para tratamentos mais assertivos. Os dados dos 500 pacientes com câncer de próstata metastático ou câncer de mama subtipo HER-2 positivo já foram coletados no triênio 2021-2023, por meio de um estudo observacional e, no triênio 2024-2026, serão coletados
os dados das 490 pacientes com subtipo triplo-negativo inicial (estádio I) e localmente avançado (estádios II e III) do câncer de mama. O projeto proporcionará aconselhamento genético às equipes médicas que acompanham pacientes nos quais se identificou alteração.

Todos os pacientes são convidados a participar do estudo de forma voluntária pelas equipes assistenciais dos centros. Em seguida, as equipes dos centros conduzem uma avaliação inicial em que são coletadas informações demográficas, clínicas e socioeconômicas dos pacientes. São coletadas amostras de sangue periférico para análise por WES germinativo. Também é solicitado ao participante a disponibilização das amostras tumorais emblocadas em parafina, decorrentes da biópsia diagnóstica, das quais se extrai material para análise por WES somático. As equipes dos centros também coletam dados referentes aos tratamentos realizados e o resultado desses tratamentos. As amostras são encaminhadas para o laboratório de biologia molecular do HMV, onde é realizada a revisão diagnóstica e preparo das amostras para sequenciamento. Pacientes sem confirmação diagnóstica são excluídos do estudo, a equipe do centros é comunicada, a amostra de sangue é descartada e a amostra tumoral é devolvida. As amostras dos pacientes em que houve a confirmação diagnóstica são preparadas e encaminhadas aos laboratórios parceiros para condução das análises de WES germinativo e somático. Devido à qualidade do material
emblocado proveniente dos laboratórios de patologia que atendem os centros participantes, estima-se que será possível a análise do genoma somático de cerca de 300 pacientes. Em caso de identificação de alterações nas análises genômicas germinativas, a equipe dos centros participantes recebem orientação para o aconselhamento genético, por meio de teleinterconsultas com geneticista. Junto às informações clínicas, as informações decorrentes do sequenciamento genômico dos participantes incluídos no estudo são vinculadas ao biobanco e banco de dados do Programa Genomas Brasil, se consentido pelo participante. Ao final da condução das análises genômicas para o grupo de pacientes com cada tipo e subtipo estudado, será conduzida uma análise de ancestralidade.